Durante l'alluvione del 1966 vennero danneggiare 1 milione e 200 mila unità bibliografiche tra le quali circa 300.000 libri della collezione Magliabechiana, della collezione dei grandi formati che giacevano nel sottosuolo della biblioteca, opere moderne e duplicati. Tra il materiale danneggiato c'erano circa 20.000 titoli di giornali e quotidiani, 10.000 di riviste, 400.000 miscellanee, collezioni di manifesti, opuscoli e i cataloghi per un totale di circa 8 milioni di schede.
Uno di volumi alluvionati ancora da restaurare (foto FAN©1996)
Fino ad oggi sono stati restaurati quasi 36.000 degli oltre 52.000 titoli del fondo Magliabechiano; dei quasi 10.000 grandi formati del fondo Palatino ne sono stati restaurati oltre 4.500 ed entro il 1996 circa 1.800 volumi e un migliaio di miscellanee sono quasi pronte per tornare sugli scaffali. Sono state recuperate anche 12.000 testate di giornali che fanno parte della maggiore collezione italiana.
Ogni giorno circa 700 utenti frequentano la Biblioteca che nei suoi 90 Km. di palchetti contiene circa 5 milioni di volumi a stampa, oltre 24.000 manoscritti, circa 3.500 incunaboli, 35.000 cinquecentine 120.000 testate di giornali periodici e oltre 1 milione di lettere e autografi. Inoltre ogni anno arrivano alla Biblioteca Nazionale Centrale di Firenze circa 40.000 titoli dei quali 13.000 sono testate periodiche vive.
